.gitignore
.pre-commit-config.yaml
LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
pytest.ini
setup.cfg
setup.py
brainreg/__init__.py
brainreg/cli.py
brainreg/main.py
brainreg/paths.py
brainreg.egg-info/PKG-INFO
brainreg.egg-info/SOURCES.txt
brainreg.egg-info/dependency_links.txt
brainreg.egg-info/entry_points.txt
brainreg.egg-info/not-zip-safe
brainreg.egg-info/requires.txt
brainreg.egg-info/top_level.txt
brainreg/backend/__init__.py
brainreg/backend/niftyreg/__init__.py
brainreg/backend/niftyreg/niftyreg_binaries.py
brainreg/backend/niftyreg/parameters.py
brainreg/backend/niftyreg/parser.py
brainreg/backend/niftyreg/paths.py
brainreg/backend/niftyreg/registration.py
brainreg/backend/niftyreg/run.py
brainreg/backend/niftyreg/utils.py
brainreg/bin/nifty_reg/LICENSE.txt
brainreg/bin/nifty_reg/niftyreg-git.zip
brainreg/bin/nifty_reg/niftyreg_version.txt
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_aladin
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_average
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_f3d
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_jacobian
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_measure
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_resample
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_tools
brainreg/bin/nifty_reg/linux_x64/reg_transform
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_aladin
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_average
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_f3d
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_jacobian
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_measure
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_resample
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_tools
brainreg/bin/nifty_reg/osX/reg_transform
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_aladin.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_average.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_f3d.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_jacobian.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_measure.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_resample.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_tools.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/reg_transform.exe
brainreg/bin/nifty_reg/win64/vcruntime140_1.dll
brainreg/utils/__init__.py
brainreg/utils/boundaries.py
brainreg/utils/misc.py
brainreg/utils/preprocess.py
brainreg/utils/volume.py