.gitignore
Dockerfile
LICENSE
README.md
conda_environment.yml
pyproject.toml
src/__init__.py
src/base.py
src/benchmark.py
src/interrogate.py
src/veta.py
src/config/__init__.py
src/config/tools_config.txt
src/config/example_imgs/.gitkeep
src/config/example_imgs/benchmark_af.png
src/config/example_imgs/benchmark_dist.png
src/config/example_imgs/benchmark_performance.png
src/config/example_imgs/benchmark_thresholds.png
src/config/example_imgs/heatmap.png
src/config/example_imgs/inspect_ratios.png
src/config/example_imgs/inspect_ratios2.png
src/config/example_imgs/logo.png
src/config/example_imgs/ml_fi.png
src/config/example_imgs/ml_performance.png
src/config/example_imgs/pearson_corr.png
src/config/example_imgs/per_bin_score.png
src/config/example_imgs/per_bin_score_split_ss.png
src/config/example_imgs/roc_analysis.png
src/config/example_imgs/roc_curves.png
src/plots/__init__.py
src/plots/plots_benchmark_mode.py
src/plots/plots_interrogate_mode.py
src/plots/plots_intronic_analysis.py
src/plots/plots_machine_learning.py
src/plots/plots_threshold_analysis.py
src/plots/plots_utils.py
src/predictions/__init__.py
src/predictions/apply.py
src/predictions/filters.py
src/predictions/introns.py
src/predictions/metapredictions.py
src/predictions/metrics.py
src/predictions/thresholds.py
src/predictions/utils_classifiers.py
src/preprocessing/__init__.py
src/preprocessing/clinvar.py
src/preprocessing/location.py
src/preprocessing/osutils.py
src/preprocessing/tables.py
src/preprocessing/utils_tools.py
src/preprocessing/vcf.py
src/veta.egg-info/PKG-INFO
src/veta.egg-info/SOURCES.txt
src/veta.egg-info/dependency_links.txt
src/veta.egg-info/entry_points.txt
src/veta.egg-info/requires.txt
src/veta.egg-info/top_level.txt